2023年7月11日,全球基因測序和芯片技術的領導者因美納(納斯達克股票代碼:ILMN)宣布推出最新版本的DRAGEN?軟件,用于分析新一代測序數據。DRAGEN 4.2將屢獲殊榮的準確性,與其備受贊譽的靈活性和可擴展性相結合,實現高效的工作流程,并從基因組數據中獲取有意義的見解。
因美納軟件和信息學副總裁Rami Mehio表示:“DRAGEN 4.2將進一步提升二級分析的準確性和全面性。在DRAGEN加入因美納的五周年之際,我們看到,基因組學已日益在臨床、精準醫學和科研領域得到了迅速的應用。DRAGEN能夠執行高質量、快速、精確且全面的NGS分析工作流程,是支持醫療健康和科研工作的理想之選。我們致力于持續、全面地改進對全基因組變異的檢測和解讀流程,為臨床醫生和科研工作者了解人類健康提供支持。”
DRAGEN v4.2改進了遺傳病病因變異的鑒定、藥物發現和群體基因組學相關的分析流程,具體包括:優化機器學習算法,提高變異檢出的靈敏度和精確性。SNV檢出程序的全新高靈敏度模式,用于檢測嵌合變異,即低等位基因頻率下的變異和基因組難比對的片段重復區域的變異。擴展多基因組(Graph)參考索引建立使用的樣本至32個來自全球的樣本,大幅提高了多樣化種族樣本的分析準確性。10 kb以下小型CNV檢測的準確性實現重大提升。支持全新的端粒到端粒CHM13v2.0參考基因組,這是第一個完整的無間隙人類基因組。四個全新的靶向檢出程序:LPA、HBA、CYP21A2和RH,支持在遺傳病、攜帶者篩查和血型鑒定方面實現進一步發現。
在最新功能中,全新的靶向檢出程序能夠進一步提升心血管疾病治療和血型鑒定能力。DRAGEN 4.2的早期合作伙伴——休斯頓貝勒醫學院人類基因組測序中心的Fritz Sedlazeck注意到了這一潛力。
Sedlazeck表示:“DRAGEN 4.2是基因組學分析的一項重大飛躍,除了SNV檢測,該軟件還可以對多種變異類型進行檢測,促進了對基因組樣本的全面分析。這些新功能包括治療心血管疾病的新方法,例如針對LP(a)的檢出程序。針對該基因開展的研究已長達四十余年,這些功能為我們提供了更深入的見解。如今,我們可以通過這一可靠的工具獲得全新發現。”
脂蛋白(a)或稱LP(a),是與心血管疾病相關且具有臨床意義的新興潛在危險因素。靶向檢出與高水平LP(a)相關的基因變異可以進一步推進臨床研究,有助于開發檢測和治療方法。
在此版本發布之前,DRAGEN 4.1已集成至NovaSeq X系列測序平臺中,該系列是因美納最新以及產品家族史上功能最強大的測序儀。
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