所有已知病毒基因組的比較。那些具有相似基因組的病毒被歸為一組,包括感染細菌(左側)、真核生物(右側和底部中心)的病毒。感染阿斯加德古菌的病毒與之前描述的病毒不同。圖片來源:得克薩斯大學奧斯汀分校
科技日報實習記者?張佳欣
美國得克 薩斯大學奧斯汀分校的研究人員在27日的《自然·微生物學》雜志上報告,首次發現了感染阿斯加德古菌的病毒,這種古菌可能是所有復雜生命的祖先。這一發現 為復雜生命的起源提供了“誘人”線索,并為探索病毒對人類和其他復雜生命形式的進化至關重要的假說提供了新的方向。
關于細胞核起源的學說有幾種假設。有一種假設得到廣泛支持,即所有復雜的生命形式,如人類、海星和樹木,它們的細胞都具有細胞核,被稱為真核生物,其起源于古菌和細菌的融合。然而,最近的研究表明,第一批真核生物是所謂的阿斯加德古菌的直系后代。
還有一種具有爭議性的“病毒性真核生物起源”假說,該假說認為病毒可能促成了復雜細胞生命的出現:病毒感染了原核生物,導致膜結合細胞核與其他真核生物特征的成型。該假說表明,除了細菌和古菌外,病毒可能對真核生物的發展作出了一些遺傳成分的貢獻。
研究人員表示,最新研究揭示了病毒如何在這段數十億年的歷史中發揮作用,雖然新發現并沒有解決關于“病毒性真核生物起源”的爭議,但它確實提供了一些線索。
新發現的病毒確實具有一些類似于感染真核生物的病毒的特征,包括復制自己的DNA和劫持宿主的蛋白質修飾系統的能力。這些病毒顯示出感染真核生物和原核生物的兩種病毒的特征,這使它們獨一無二,因為它們與感染其他古菌或復雜生命形式的病毒不完全相同。
這項研究的通訊作者、海洋科學和綜合生物學副教授布雷特·貝克說,最令人興奮的是,它們是一種全新的病毒類型,與人們以前在古菌和真核生物中看到的病毒不同,這種病毒會感染微生物親屬(阿斯加德古菌)。
阿斯加德古菌可能是在20多億年前進化出來的,其后代仍然活著,在世界各地的深海沉積物和溫泉中都發現了這種古菌,但到目前為止,只有一種菌株在實驗室中 成功生長。為了識別它們,科學家從環境中收集它們的遺傳物質,然后拼湊出它們的基因組。在這項最新的研究中,研究人員掃描了阿斯加德古菌基因組,尋找被稱 為CRISPR陣列的重復DNA區域,該陣列包含可以與之前感染這些微生物的病毒精確匹配的小片段病毒DNA。這些基因“指紋”使研究人員能夠識別這些隱 形的病毒入侵者,這些病毒侵入者在真核生物復雜的起源故事中扮演著關鍵角色。
研究人員表示,這項研究為更好地解決真核生物的起源和了解病毒在阿斯加德古菌的生態和進化中的作用打開了一扇門。
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