科技日報實習記者?張佳欣

許多救命藥物直接與DNA相互作用以治療癌癥等疾病，但科學家們一直很難理解它們如何以及為何起作用。近日，英國劍橋大學的研究人員在《自然·生物技術》雜志上發表的一篇論文中提出了一種新的DNA測序法，可檢測小分子藥物與基因組之間的特定位置和相互作用。

研究人員創造了一種名為Chem-map的新DNA測序技術，能夠以前所未有的精度原位繪制小分子—基因組相互作用。
圖片來源：美國《每日科技》網

“了解藥物在體內的作用方式對于創造更好、更有效的治療方法至關重要。”劍橋大學優素福·哈米德化學系余祖濤（音譯）博士說，“但當一種治療藥物進入具有30億個堿基的癌細胞基因組時，就像進入了一個黑匣子。”

這種方法名為Chem-map，利用它，研究人員通過一種名為小分子定向轉座酶Tn5標記的策略，以前所未有的精度進行小分子—基因組相互作用的原位測 繪。也就是說，研究人員能夠檢測小分子藥物與DNA基因組上的目標相互作用的位置，從而打開了這個基因組的“黑匣子”。

每年，數以百萬計的癌癥患者接受基因組靶向藥物（例如阿霉素）的治療。這項研究中，研究人員使用Chem-map來確定廣泛使用的抗癌藥物阿霉素在人類白血病細胞中的直接結合部位。

該技術表明，在暴露于組蛋白脫乙酰酶（HDAC）抑制劑西達本胺的細胞上使用阿霉素的聯合治療，可能具有潛在的臨床優勢。

這項技術還被用來繪制DNA G-四鏈體上某些分子的結合位置，即G4s。G4s是四鏈二級結構，與基因調控有關，可能成為未來抗癌治療的靶點。

研究人員表示，Chem-map可以精確地繪制出藥物與基因組結合的位置，能為一些藥物療法如何與人類基因組相互作用提供大量新見解，并使開發更有效和更安全的治療藥物變得更容易。